Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Gm8444F6XS56 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm8444F6XS56 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm8444F6XS56 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms