Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P2

Cacna1i, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 2,199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1iE9Q7P2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Mrgpra4-201ENSMUST00000087092 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Cacna1iE9Q7P2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Cacna1iE9Q7P2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms