Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Vmn1r68E9Q0V3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Vmn1r68E9Q0V3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms