Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20425E9Q035 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20425E9Q035 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20425E9Q035 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm20425E9Q035 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20425E9Q035 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20425E9Q035 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20425E9Q035 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm20425E9Q035 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm20425E9Q035 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gm20425E9Q035 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gm20425E9Q035 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms