Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ccdc13D3YV10 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ccdc13D3YV10 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms