Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
4930444P10RikD3YUR1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms