Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clrn2B2RVW2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clrn2B2RVW2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clrn2B2RVW2 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms