Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Apba1B2RUJ5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Apba1B2RUJ5 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.1 ms