Protein–RNA interactions for Protein: B1B212

H60b, Histocompatibility antigen 60b, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60bB1B212 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
H60bB1B212 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
H60bB1B212 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.9 ms