Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pm20d2A3KG59 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Pm20d2A3KG59 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms