Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cdc27A2A6Q5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cdc27A2A6Q5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cdc27A2A6Q5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms