Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gm27029A2A4P4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gm27029A2A4P4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 172.7 ms