Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
1700019A02RikA0A087WPV9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
1700019A02RikA0A087WPV9 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms