Protein–RNA interactions for Protein: S4R1R7

Rpl9-ps1, MCG50795, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl9-ps1S4R1R7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpl9-ps1S4R1R7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rpl9-ps1S4R1R7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Rpl9-ps1S4R1R7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rpl9-ps1S4R1R7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Rpl9-ps1S4R1R7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rpl9-ps1S4R1R7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rpl9-ps1S4R1R7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rpl9-ps1S4R1R7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rpl9-ps1S4R1R7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rpl9-ps1S4R1R7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rpl9-ps1S4R1R7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpl9-ps1S4R1R7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpl9-ps1S4R1R7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rpl9-ps1S4R1R7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpl9-ps1S4R1R7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rpl9-ps1S4R1R7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rpl9-ps1S4R1R7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rpl9-ps1S4R1R7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rpl9-ps1S4R1R7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpl9-ps1S4R1R7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rpl9-ps1S4R1R7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rpl9-ps1S4R1R7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Rpl9-ps1S4R1R7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Rpl9-ps1S4R1R7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rpl9-ps1S4R1R7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpl9-ps1S4R1R7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Rpl9-ps1S4R1R7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rpl9-ps1S4R1R7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpl9-ps1S4R1R7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rpl9-ps1S4R1R7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rpl9-ps1S4R1R7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rpl9-ps1S4R1R7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rpl9-ps1S4R1R7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpl9-ps1S4R1R7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Rpl9-ps1S4R1R7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Rpl9-ps1S4R1R7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rpl9-ps1S4R1R7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpl9-ps1S4R1R7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rpl9-ps1S4R1R7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rpl9-ps1S4R1R7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpl9-ps1S4R1R7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Rpl9-ps1S4R1R7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpl9-ps1S4R1R7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rpl9-ps1S4R1R7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpl9-ps1S4R1R7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Rpl9-ps1S4R1R7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rpl9-ps1S4R1R7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rpl9-ps1S4R1R7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpl9-ps1S4R1R7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rpl9-ps1S4R1R7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rpl9-ps1S4R1R7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rpl9-ps1S4R1R7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Rpl9-ps1S4R1R7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rpl9-ps1S4R1R7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Rpl9-ps1S4R1R7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Rpl9-ps1S4R1R7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpl9-ps1S4R1R7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rpl9-ps1S4R1R7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpl9-ps1S4R1R7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpl9-ps1S4R1R7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rpl9-ps1S4R1R7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rpl9-ps1S4R1R7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpl9-ps1S4R1R7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpl9-ps1S4R1R7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rpl9-ps1S4R1R7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpl9-ps1S4R1R7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rpl9-ps1S4R1R7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rpl9-ps1S4R1R7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rpl9-ps1S4R1R7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rpl9-ps1S4R1R7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 371.8 ms