Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ccdc166S4R181 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc166S4R181 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ccdc166S4R181 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc166S4R181 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccdc166S4R181 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc166S4R181 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ccdc166S4R181 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ccdc166S4R181 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ccdc166S4R181 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccdc166S4R181 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc166S4R181 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccdc166S4R181 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc166S4R181 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc166S4R181 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc166S4R181 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccdc166S4R181 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccdc166S4R181 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccdc166S4R181 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccdc166S4R181 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc166S4R181 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccdc166S4R181 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc166S4R181 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccdc166S4R181 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccdc166S4R181 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc166S4R181 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccdc166S4R181 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccdc166S4R181 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc166S4R181 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ccdc166S4R181 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc166S4R181 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ccdc166S4R181 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccdc166S4R181 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccdc166S4R181 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc166S4R181 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccdc166S4R181 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc166S4R181 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccdc166S4R181 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc166S4R181 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccdc166S4R181 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc166S4R181 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc166S4R181 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccdc166S4R181 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccdc166S4R181 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ccdc166S4R181 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc166S4R181 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc166S4R181 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc166S4R181 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc166S4R181 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc166S4R181 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc166S4R181 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc166S4R181 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc166S4R181 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc166S4R181 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc166S4R181 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc166S4R181 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc166S4R181 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms