Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M6

Cd97, CD97 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd97Q9Z0M6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cd97Q9Z0M6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cd97Q9Z0M6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cd97Q9Z0M6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Cd97Q9Z0M6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cd97Q9Z0M6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cd97Q9Z0M6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cd97Q9Z0M6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cd97Q9Z0M6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd97Q9Z0M6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cd97Q9Z0M6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cd97Q9Z0M6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd97Q9Z0M6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd97Q9Z0M6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cd97Q9Z0M6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cd97Q9Z0M6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd97Q9Z0M6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd97Q9Z0M6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cd97Q9Z0M6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd97Q9Z0M6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cd97Q9Z0M6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cd97Q9Z0M6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cd97Q9Z0M6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Cd97Q9Z0M6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cd97Q9Z0M6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cd97Q9Z0M6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cd97Q9Z0M6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Cd97Q9Z0M6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cd97Q9Z0M6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cd97Q9Z0M6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cd97Q9Z0M6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cd97Q9Z0M6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd97Q9Z0M6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cd97Q9Z0M6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cd97Q9Z0M6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cd97Q9Z0M6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cd97Q9Z0M6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cd97Q9Z0M6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd97Q9Z0M6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cd97Q9Z0M6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Cd97Q9Z0M6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd97Q9Z0M6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cd97Q9Z0M6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd97Q9Z0M6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd97Q9Z0M6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cd97Q9Z0M6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cd97Q9Z0M6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd97Q9Z0M6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cd97Q9Z0M6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd97Q9Z0M6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd97Q9Z0M6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cd97Q9Z0M6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cd97Q9Z0M6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Cd97Q9Z0M6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cd97Q9Z0M6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cd97Q9Z0M6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cd97Q9Z0M6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cd97Q9Z0M6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cd97Q9Z0M6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cd97Q9Z0M6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cd97Q9Z0M6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd97Q9Z0M6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cd97Q9Z0M6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cd97Q9Z0M6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Cd97Q9Z0M6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd97Q9Z0M6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cd97Q9Z0M6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cd97Q9Z0M6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd97Q9Z0M6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Cd97Q9Z0M6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cd97Q9Z0M6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Cd97Q9Z0M6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cd97Q9Z0M6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd97Q9Z0M6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms