Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H0

Acox1, Peroxisomal acyl-coenzyme A oxidase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acox1Q9R0H0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Acox1Q9R0H0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Acox1Q9R0H0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Acox1Q9R0H0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Acox1Q9R0H0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Acox1Q9R0H0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acox1Q9R0H0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Acox1Q9R0H0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Acox1Q9R0H0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Acox1Q9R0H0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acox1Q9R0H0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Acox1Q9R0H0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Acox1Q9R0H0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acox1Q9R0H0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Acox1Q9R0H0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Acox1Q9R0H0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acox1Q9R0H0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Acox1Q9R0H0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Acox1Q9R0H0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Acox1Q9R0H0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acox1Q9R0H0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Acox1Q9R0H0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Acox1Q9R0H0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Acox1Q9R0H0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Acox1Q9R0H0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Acox1Q9R0H0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Acox1Q9R0H0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Acox1Q9R0H0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acox1Q9R0H0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Acox1Q9R0H0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Acox1Q9R0H0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acox1Q9R0H0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Acox1Q9R0H0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Acox1Q9R0H0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acox1Q9R0H0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Acox1Q9R0H0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Acox1Q9R0H0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Acox1Q9R0H0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acox1Q9R0H0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Acox1Q9R0H0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acox1Q9R0H0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Acox1Q9R0H0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Acox1Q9R0H0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Acox1Q9R0H0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acox1Q9R0H0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Acox1Q9R0H0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Acox1Q9R0H0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Acox1Q9R0H0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Acox1Q9R0H0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Acox1Q9R0H0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms