Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gpc6Q9R087 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpc6Q9R087 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gpc6Q9R087 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gpc6Q9R087 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gpc6Q9R087 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gpc6Q9R087 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gpc6Q9R087 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gpc6Q9R087 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gpc6Q9R087 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Gpc6Q9R087 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpc6Q9R087 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpc6Q9R087 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gpc6Q9R087 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpc6Q9R087 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpc6Q9R087 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gpc6Q9R087 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gpc6Q9R087 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gpc6Q9R087 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gpc6Q9R087 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gpc6Q9R087 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gpc6Q9R087 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc6Q9R087 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gpc6Q9R087 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gpc6Q9R087 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gpc6Q9R087 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc6Q9R087 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gpc6Q9R087 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc6Q9R087 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Gpc6Q9R087 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gpc6Q9R087 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Gpc6Q9R087 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc6Q9R087 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc6Q9R087 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gpc6Q9R087 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc6Q9R087 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gpc6Q9R087 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gpc6Q9R087 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Gpc6Q9R087 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc6Q9R087 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc6Q9R087 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gpc6Q9R087 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gpc6Q9R087 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc6Q9R087 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc6Q9R087 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gpc6Q9R087 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gpc6Q9R087 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gpc6Q9R087 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gpc6Q9R087 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gpc6Q9R087 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gpc6Q9R087 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gpc6Q9R087 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms