Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM83

Calm4, Calmodulin-4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm4Q9JM83 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Calm4Q9JM83 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Calm4Q9JM83 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Calm4Q9JM83 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm4Q9JM83 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calm4Q9JM83 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calm4Q9JM83 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calm4Q9JM83 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calm4Q9JM83 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Calm4Q9JM83 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Calm4Q9JM83 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Calm4Q9JM83 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calm4Q9JM83 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Calm4Q9JM83 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Calm4Q9JM83 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Calm4Q9JM83 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Calm4Q9JM83 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Calm4Q9JM83 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Calm4Q9JM83 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Calm4Q9JM83 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms