Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tssc4Q9JHE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tssc4Q9JHE7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Tssc4Q9JHE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tssc4Q9JHE7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tssc4Q9JHE7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tssc4Q9JHE7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Tssc4Q9JHE7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tssc4Q9JHE7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tssc4Q9JHE7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tssc4Q9JHE7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tssc4Q9JHE7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Tssc4Q9JHE7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Tssc4Q9JHE7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Tssc4Q9JHE7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tssc4Q9JHE7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tssc4Q9JHE7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tssc4Q9JHE7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tssc4Q9JHE7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tssc4Q9JHE7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tssc4Q9JHE7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tssc4Q9JHE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tssc4Q9JHE7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tssc4Q9JHE7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tssc4Q9JHE7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tssc4Q9JHE7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tssc4Q9JHE7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tssc4Q9JHE7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tssc4Q9JHE7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tssc4Q9JHE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tssc4Q9JHE7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tssc4Q9JHE7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tssc4Q9JHE7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tssc4Q9JHE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tssc4Q9JHE7 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tssc4Q9JHE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tssc4Q9JHE7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tssc4Q9JHE7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tssc4Q9JHE7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tssc4Q9JHE7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tssc4Q9JHE7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tssc4Q9JHE7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tssc4Q9JHE7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tssc4Q9JHE7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tssc4Q9JHE7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tssc4Q9JHE7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tssc4Q9JHE7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tssc4Q9JHE7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tssc4Q9JHE7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tssc4Q9JHE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tssc4Q9JHE7 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tssc4Q9JHE7 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tssc4Q9JHE7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tssc4Q9JHE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tssc4Q9JHE7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tssc4Q9JHE7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tssc4Q9JHE7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Tssc4Q9JHE7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Tssc4Q9JHE7 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tssc4Q9JHE7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Tssc4Q9JHE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tssc4Q9JHE7 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tssc4Q9JHE7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tssc4Q9JHE7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms