Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ms4a4bQ9ES61 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ms4a4bQ9ES61 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Ms4a4bQ9ES61 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ms4a4bQ9ES61 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ms4a4bQ9ES61 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Ms4a4bQ9ES61 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ms4a4bQ9ES61 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ms4a4bQ9ES61 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ms4a4bQ9ES61 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms