Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Scn4aQ9ER60 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC38.98■■■■□ 3.83
Scn4aQ9ER60 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.97■■■■□ 3.83
Scn4aQ9ER60 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.93■■■■□ 3.82
Scn4aQ9ER60 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC38.93■■■■□ 3.82
Scn4aQ9ER60 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
Scn4aQ9ER60 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.91■■■■□ 3.82
Scn4aQ9ER60 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Scn4aQ9ER60 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.91■■■■□ 3.82
Scn4aQ9ER60 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Scn4aQ9ER60 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.87■■■■□ 3.81
Scn4aQ9ER60 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
Scn4aQ9ER60 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
Scn4aQ9ER60 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
Scn4aQ9ER60 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
Scn4aQ9ER60 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
Scn4aQ9ER60 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38.74■■■■□ 3.79
Scn4aQ9ER60 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Scn4aQ9ER60 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38.71■■■■□ 3.79
Scn4aQ9ER60 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Scn4aQ9ER60 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38.7■■■■□ 3.79
Scn4aQ9ER60 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Scn4aQ9ER60 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.69■■■■□ 3.78
Scn4aQ9ER60 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Scn4aQ9ER60 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Scn4aQ9ER60 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC38.6■■■■□ 3.77
Scn4aQ9ER60 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC38.59■■■■□ 3.77
Scn4aQ9ER60 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC38.59■■■■□ 3.77
Scn4aQ9ER60 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Scn4aQ9ER60 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Scn4aQ9ER60 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Scn4aQ9ER60 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.53■■■■□ 3.76
Scn4aQ9ER60 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
Scn4aQ9ER60 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.52■■■■□ 3.76
Scn4aQ9ER60 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38.51■■■■□ 3.76
Scn4aQ9ER60 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
Scn4aQ9ER60 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Scn4aQ9ER60 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
Scn4aQ9ER60 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC38.42■■■■□ 3.74
Scn4aQ9ER60 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
Scn4aQ9ER60 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
Scn4aQ9ER60 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
Scn4aQ9ER60 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
Scn4aQ9ER60 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
Scn4aQ9ER60 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
Scn4aQ9ER60 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
Scn4aQ9ER60 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.71
Scn4aQ9ER60 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
Scn4aQ9ER60 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC38.24■■■■□ 3.71
Scn4aQ9ER60 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
Scn4aQ9ER60 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
Scn4aQ9ER60 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
Scn4aQ9ER60 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
Scn4aQ9ER60 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
Scn4aQ9ER60 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC38.17■■■■□ 3.7
Scn4aQ9ER60 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Scn4aQ9ER60 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
Scn4aQ9ER60 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Scn4aQ9ER60 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC38.08■■■■□ 3.69
Scn4aQ9ER60 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
Scn4aQ9ER60 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Scn4aQ9ER60 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Scn4aQ9ER60 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
Scn4aQ9ER60 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
Scn4aQ9ER60 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
Scn4aQ9ER60 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
Scn4aQ9ER60 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
Scn4aQ9ER60 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
Scn4aQ9ER60 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Scn4aQ9ER60 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Scn4aQ9ER60 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
Scn4aQ9ER60 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Scn4aQ9ER60 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Scn4aQ9ER60 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Scn4aQ9ER60 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Scn4aQ9ER60 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Scn4aQ9ER60 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Scn4aQ9ER60 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Scn4aQ9ER60 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Scn4aQ9ER60 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Scn4aQ9ER60 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
Scn4aQ9ER60 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
Scn4aQ9ER60 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Scn4aQ9ER60 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Scn4aQ9ER60 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
Scn4aQ9ER60 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Scn4aQ9ER60 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Scn4aQ9ER60 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37.42■■■■□ 3.58
Scn4aQ9ER60 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Scn4aQ9ER60 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Scn4aQ9ER60 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Scn4aQ9ER60 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms