Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPV7

9530002B09Rik, AUMP, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9530002B09RikQ9EPV7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
9530002B09RikQ9EPV7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
9530002B09RikQ9EPV7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
9530002B09RikQ9EPV7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
9530002B09RikQ9EPV7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
9530002B09RikQ9EPV7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
9530002B09RikQ9EPV7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
9530002B09RikQ9EPV7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.31■■□□□ 1
9530002B09RikQ9EPV7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
9530002B09RikQ9EPV7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
9530002B09RikQ9EPV7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
9530002B09RikQ9EPV7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.27■■□□□ 1
9530002B09RikQ9EPV7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
9530002B09RikQ9EPV7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
9530002B09RikQ9EPV7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
9530002B09RikQ9EPV7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
9530002B09RikQ9EPV7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
9530002B09RikQ9EPV7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
9530002B09RikQ9EPV7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms