Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP96

Slco1a4, Solute carrier organic anion transporter family member 1A4, mousemouse

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1a4Q9EP96 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Slco1a4Q9EP96 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Slco1a4Q9EP96 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Slco1a4Q9EP96 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Slco1a4Q9EP96 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco1a4Q9EP96 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco1a4Q9EP96 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Slco1a4Q9EP96 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slco1a4Q9EP96 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slco1a4Q9EP96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Slco1a4Q9EP96 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Slco1a4Q9EP96 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Slco1a4Q9EP96 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Slco1a4Q9EP96 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Slco1a4Q9EP96 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slco1a4Q9EP96 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Slco1a4Q9EP96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Slco1a4Q9EP96 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slco1a4Q9EP96 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Slco1a4Q9EP96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Slco1a4Q9EP96 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slco1a4Q9EP96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slco1a4Q9EP96 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slco1a4Q9EP96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms