Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem239Q9DA47 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem239Q9DA47 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem239Q9DA47 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tmem239Q9DA47 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Tmem239Q9DA47 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Tmem239Q9DA47 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Tmem239Q9DA47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Tmem239Q9DA47 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms