Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Smco2Q9DA21 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Smco2Q9DA21 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Smco2Q9DA21 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Smco2Q9DA21 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smco2Q9DA21 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Smco2Q9DA21 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smco2Q9DA21 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Smco2Q9DA21 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Smco2Q9DA21 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smco2Q9DA21 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smco2Q9DA21 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Smco2Q9DA21 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Smco2Q9DA21 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Smco2Q9DA21 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smco2Q9DA21 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Smco2Q9DA21 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Smco2Q9DA21 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smco2Q9DA21 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Smco2Q9DA21 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Smco2Q9DA21 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Smco2Q9DA21 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smco2Q9DA21 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Smco2Q9DA21 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Smco2Q9DA21 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smco2Q9DA21 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Smco2Q9DA21 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smco2Q9DA21 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Smco2Q9DA21 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Smco2Q9DA21 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Smco2Q9DA21 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Smco2Q9DA21 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Smco2Q9DA21 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Smco2Q9DA21 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smco2Q9DA21 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Smco2Q9DA21 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smco2Q9DA21 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smco2Q9DA21 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smco2Q9DA21 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smco2Q9DA21 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smco2Q9DA21 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smco2Q9DA21 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Smco2Q9DA21 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Smco2Q9DA21 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Smco2Q9DA21 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Smco2Q9DA21 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Smco2Q9DA21 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Smco2Q9DA21 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smco2Q9DA21 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Smco2Q9DA21 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smco2Q9DA21 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smco2Q9DA21 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Smco2Q9DA21 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Smco2Q9DA21 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Smco2Q9DA21 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Smco2Q9DA21 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Smco2Q9DA21 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Smco2Q9DA21 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Smco2Q9DA21 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Smco2Q9DA21 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Smco2Q9DA21 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smco2Q9DA21 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Smco2Q9DA21 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smco2Q9DA21 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Smco2Q9DA21 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Smco2Q9DA21 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Smco2Q9DA21 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Smco2Q9DA21 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smco2Q9DA21 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Smco2Q9DA21 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smco2Q9DA21 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smco2Q9DA21 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Smco2Q9DA21 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Smco2Q9DA21 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms