Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cldn34b2Q9D9N2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn34b2Q9D9N2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cldn34b2Q9D9N2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cldn34b2Q9D9N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cldn34b2Q9D9N2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cldn34b2Q9D9N2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn34b2Q9D9N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cldn34b2Q9D9N2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cldn34b2Q9D9N2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cldn34b2Q9D9N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cldn34b2Q9D9N2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cldn34b2Q9D9N2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cldn34b2Q9D9N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Cldn34b2Q9D9N2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cldn34b2Q9D9N2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cldn34b2Q9D9N2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cldn34b2Q9D9N2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cldn34b2Q9D9N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cldn34b2Q9D9N2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cldn34b2Q9D9N2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cldn34b2Q9D9N2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cldn34b2Q9D9N2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cldn34b2Q9D9N2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cldn34b2Q9D9N2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cldn34b2Q9D9N2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cldn34b2Q9D9N2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Cldn34b2Q9D9N2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cldn34b2Q9D9N2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cldn34b2Q9D9N2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cldn34b2Q9D9N2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cldn34b2Q9D9N2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cldn34b2Q9D9N2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cldn34b2Q9D9N2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldn34b2Q9D9N2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cldn34b2Q9D9N2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cldn34b2Q9D9N2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cldn34b2Q9D9N2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cldn34b2Q9D9N2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cldn34b2Q9D9N2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cldn34b2Q9D9N2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cldn34b2Q9D9N2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cldn34b2Q9D9N2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cldn34b2Q9D9N2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cldn34b2Q9D9N2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn34b2Q9D9N2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cldn34b2Q9D9N2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cldn34b2Q9D9N2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn34b2Q9D9N2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn34b2Q9D9N2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn34b2Q9D9N2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn34b2Q9D9N2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cldn34b2Q9D9N2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
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