Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vstm5Q9D806 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Vstm5Q9D806 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vstm5Q9D806 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vstm5Q9D806 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm5Q9D806 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vstm5Q9D806 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm5Q9D806 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vstm5Q9D806 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm5Q9D806 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vstm5Q9D806 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm5Q9D806 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Vstm5Q9D806 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Vstm5Q9D806 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Vstm5Q9D806 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Vstm5Q9D806 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Vstm5Q9D806 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Vstm5Q9D806 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Vstm5Q9D806 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm5Q9D806 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Vstm5Q9D806 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Vstm5Q9D806 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm5Q9D806 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm5Q9D806 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Vstm5Q9D806 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vstm5Q9D806 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vstm5Q9D806 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vstm5Q9D806 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Vstm5Q9D806 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Vstm5Q9D806 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vstm5Q9D806 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm5Q9D806 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm5Q9D806 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vstm5Q9D806 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vstm5Q9D806 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Vstm5Q9D806 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Vstm5Q9D806 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms