Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Med8Q9D7W5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Med8Q9D7W5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Med8Q9D7W5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Med8Q9D7W5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Med8Q9D7W5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Med8Q9D7W5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Med8Q9D7W5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Med8Q9D7W5 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Med8Q9D7W5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Med8Q9D7W5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Med8Q9D7W5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med8Q9D7W5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med8Q9D7W5 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med8Q9D7W5 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Med8Q9D7W5 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Med8Q9D7W5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Med8Q9D7W5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Med8Q9D7W5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Med8Q9D7W5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Med8Q9D7W5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Med8Q9D7W5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Med8Q9D7W5 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med8Q9D7W5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med8Q9D7W5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Med8Q9D7W5 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med8Q9D7W5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med8Q9D7W5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Med8Q9D7W5 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Med8Q9D7W5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med8Q9D7W5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Med8Q9D7W5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Med8Q9D7W5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med8Q9D7W5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med8Q9D7W5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Med8Q9D7W5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Med8Q9D7W5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Med8Q9D7W5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Med8Q9D7W5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Med8Q9D7W5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Med8Q9D7W5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Med8Q9D7W5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Med8Q9D7W5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med8Q9D7W5 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Med8Q9D7W5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms