Protein–RNA interactions for Protein: Q9D496

4930548H24Rik, RIKEN cDNA 4930548H24, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930548H24RikQ9D496 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
4930548H24RikQ9D496 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
4930548H24RikQ9D496 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
4930548H24RikQ9D496 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
4930548H24RikQ9D496 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
4930548H24RikQ9D496 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930548H24RikQ9D496 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
4930548H24RikQ9D496 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
4930548H24RikQ9D496 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
4930548H24RikQ9D496 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
4930548H24RikQ9D496 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
4930548H24RikQ9D496 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
4930548H24RikQ9D496 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930548H24RikQ9D496 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
4930548H24RikQ9D496 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
4930548H24RikQ9D496 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
4930548H24RikQ9D496 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
4930548H24RikQ9D496 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
4930548H24RikQ9D496 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4930548H24RikQ9D496 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
4930548H24RikQ9D496 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
4930548H24RikQ9D496 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
4930548H24RikQ9D496 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
4930548H24RikQ9D496 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
4930548H24RikQ9D496 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930548H24RikQ9D496 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930548H24RikQ9D496 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
4930548H24RikQ9D496 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930548H24RikQ9D496 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
4930548H24RikQ9D496 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930548H24RikQ9D496 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
4930548H24RikQ9D496 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
4930548H24RikQ9D496 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
4930548H24RikQ9D496 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
4930548H24RikQ9D496 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930548H24RikQ9D496 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
4930548H24RikQ9D496 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
4930548H24RikQ9D496 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
4930548H24RikQ9D496 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
4930548H24RikQ9D496 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
4930548H24RikQ9D496 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
4930548H24RikQ9D496 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
4930548H24RikQ9D496 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
4930548H24RikQ9D496 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.56■■■□□ 2
4930548H24RikQ9D496 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
4930548H24RikQ9D496 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.54■■■□□ 2
4930548H24RikQ9D496 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930548H24RikQ9D496 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
4930548H24RikQ9D496 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
4930548H24RikQ9D496 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
4930548H24RikQ9D496 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930548H24RikQ9D496 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
4930548H24RikQ9D496 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930548H24RikQ9D496 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
4930548H24RikQ9D496 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
4930548H24RikQ9D496 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
4930548H24RikQ9D496 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
4930548H24RikQ9D496 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
4930548H24RikQ9D496 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms