Protein–RNA interactions for Protein: Q9D416

Arl13a, ADP-ribosylation factor-like protein 13A, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl13aQ9D416 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Arl13aQ9D416 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Arl13aQ9D416 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Arl13aQ9D416 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Arl13aQ9D416 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Arl13aQ9D416 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Arl13aQ9D416 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Arl13aQ9D416 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arl13aQ9D416 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arl13aQ9D416 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Arl13aQ9D416 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Arl13aQ9D416 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Arl13aQ9D416 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arl13aQ9D416 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arl13aQ9D416 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Arl13aQ9D416 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl13aQ9D416 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Arl13aQ9D416 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Arl13aQ9D416 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Arl13aQ9D416 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arl13aQ9D416 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Arl13aQ9D416 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Arl13aQ9D416 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Arl13aQ9D416 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Arl13aQ9D416 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Arl13aQ9D416 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Arl13aQ9D416 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Arl13aQ9D416 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Arl13aQ9D416 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Arl13aQ9D416 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Arl13aQ9D416 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Arl13aQ9D416 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Arl13aQ9D416 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Arl13aQ9D416 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Arl13aQ9D416 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Arl13aQ9D416 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Arl13aQ9D416 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arl13aQ9D416 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Arl13aQ9D416 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Arl13aQ9D416 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Arl13aQ9D416 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Arl13aQ9D416 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl13aQ9D416 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Arl13aQ9D416 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arl13aQ9D416 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arl13aQ9D416 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Arl13aQ9D416 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Arl13aQ9D416 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Arl13aQ9D416 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Arl13aQ9D416 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Arl13aQ9D416 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Arl13aQ9D416 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Arl13aQ9D416 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Arl13aQ9D416 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl13aQ9D416 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Arl13aQ9D416 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Arl13aQ9D416 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Arl13aQ9D416 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Arl13aQ9D416 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arl13aQ9D416 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Arl13aQ9D416 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Arl13aQ9D416 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Arl13aQ9D416 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Arl13aQ9D416 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Arl13aQ9D416 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Arl13aQ9D416 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Arl13aQ9D416 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arl13aQ9D416 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Arl13aQ9D416 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Arl13aQ9D416 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Arl13aQ9D416 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl13aQ9D416 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl13aQ9D416 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Arl13aQ9D416 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms