Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933436I01RikQ9D3T1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933436I01RikQ9D3T1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933436I01RikQ9D3T1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933436I01RikQ9D3T1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933436I01RikQ9D3T1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933436I01RikQ9D3T1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933436I01RikQ9D3T1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933436I01RikQ9D3T1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933436I01RikQ9D3T1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933436I01RikQ9D3T1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933436I01RikQ9D3T1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933436I01RikQ9D3T1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933436I01RikQ9D3T1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4933436I01RikQ9D3T1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
4933436I01RikQ9D3T1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
4933436I01RikQ9D3T1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
4933436I01RikQ9D3T1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933436I01RikQ9D3T1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933436I01RikQ9D3T1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
4933436I01RikQ9D3T1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
4933436I01RikQ9D3T1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
4933436I01RikQ9D3T1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
4933436I01RikQ9D3T1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
4933436I01RikQ9D3T1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
4933436I01RikQ9D3T1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933436I01RikQ9D3T1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
4933436I01RikQ9D3T1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
4933436I01RikQ9D3T1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933436I01RikQ9D3T1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
4933436I01RikQ9D3T1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
4933436I01RikQ9D3T1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
4933436I01RikQ9D3T1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
4933436I01RikQ9D3T1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933436I01RikQ9D3T1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
4933436I01RikQ9D3T1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
4933436I01RikQ9D3T1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
4933436I01RikQ9D3T1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms