Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B0

Srsf9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf9Q9D0B0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Srsf9Q9D0B0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Srsf9Q9D0B0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Srsf9Q9D0B0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Srsf9Q9D0B0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Srsf9Q9D0B0 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Srsf9Q9D0B0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf9Q9D0B0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Srsf9Q9D0B0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf9Q9D0B0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Srsf9Q9D0B0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Srsf9Q9D0B0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf9Q9D0B0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Srsf9Q9D0B0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Srsf9Q9D0B0 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srsf9Q9D0B0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srsf9Q9D0B0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms