Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZA6

Nde1, Nuclear distribution protein nudE homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nde1Q9CZA6 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Nde1Q9CZA6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nde1Q9CZA6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nde1Q9CZA6 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Nde1Q9CZA6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Nde1Q9CZA6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nde1Q9CZA6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Nde1Q9CZA6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nde1Q9CZA6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nde1Q9CZA6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nde1Q9CZA6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nde1Q9CZA6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nde1Q9CZA6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nde1Q9CZA6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nde1Q9CZA6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nde1Q9CZA6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nde1Q9CZA6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nde1Q9CZA6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nde1Q9CZA6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nde1Q9CZA6 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nde1Q9CZA6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nde1Q9CZA6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nde1Q9CZA6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nde1Q9CZA6 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nde1Q9CZA6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nde1Q9CZA6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nde1Q9CZA6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nde1Q9CZA6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Nde1Q9CZA6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nde1Q9CZA6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Nde1Q9CZA6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Nde1Q9CZA6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms