Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU2

Zdhhc13, Palmitoyltransferase ZDHHC13, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc13Q9CWU2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Zdhhc13Q9CWU2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zdhhc13Q9CWU2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zdhhc13Q9CWU2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zdhhc13Q9CWU2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zdhhc13Q9CWU2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zdhhc13Q9CWU2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zdhhc13Q9CWU2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zdhhc13Q9CWU2 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zdhhc13Q9CWU2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zdhhc13Q9CWU2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zdhhc13Q9CWU2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zdhhc13Q9CWU2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zdhhc13Q9CWU2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zdhhc13Q9CWU2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zdhhc13Q9CWU2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zdhhc13Q9CWU2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zdhhc13Q9CWU2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zdhhc13Q9CWU2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zdhhc13Q9CWU2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Zdhhc13Q9CWU2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zdhhc13Q9CWU2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zdhhc13Q9CWU2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Zdhhc13Q9CWU2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zdhhc13Q9CWU2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Zdhhc13Q9CWU2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zdhhc13Q9CWU2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms