Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atxn3Q9CVD2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
Atxn3Q9CVD2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atxn3Q9CVD2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atxn3Q9CVD2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Atxn3Q9CVD2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Atxn3Q9CVD2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atxn3Q9CVD2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atxn3Q9CVD2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Atxn3Q9CVD2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Atxn3Q9CVD2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Atxn3Q9CVD2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Atxn3Q9CVD2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Atxn3Q9CVD2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Atxn3Q9CVD2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Atxn3Q9CVD2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Atxn3Q9CVD2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atxn3Q9CVD2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Atxn3Q9CVD2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Atxn3Q9CVD2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atxn3Q9CVD2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atxn3Q9CVD2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Atxn3Q9CVD2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Atxn3Q9CVD2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Atxn3Q9CVD2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Atxn3Q9CVD2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Atxn3Q9CVD2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Atxn3Q9CVD2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Atxn3Q9CVD2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Atxn3Q9CVD2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atxn3Q9CVD2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Atxn3Q9CVD2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Atxn3Q9CVD2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Atxn3Q9CVD2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Atxn3Q9CVD2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Atxn3Q9CVD2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Atxn3Q9CVD2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Atxn3Q9CVD2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atxn3Q9CVD2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Atxn3Q9CVD2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
Atxn3Q9CVD2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Atxn3Q9CVD2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Atxn3Q9CVD2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Atxn3Q9CVD2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
Atxn3Q9CVD2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atxn3Q9CVD2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
Atxn3Q9CVD2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Atxn3Q9CVD2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Atxn3Q9CVD2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Atxn3Q9CVD2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atxn3Q9CVD2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
Atxn3Q9CVD2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Atxn3Q9CVD2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atxn3Q9CVD2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Atxn3Q9CVD2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atxn3Q9CVD2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atxn3Q9CVD2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atxn3Q9CVD2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atxn3Q9CVD2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atxn3Q9CVD2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Atxn3Q9CVD2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Atxn3Q9CVD2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Atxn3Q9CVD2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Atxn3Q9CVD2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atxn3Q9CVD2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atxn3Q9CVD2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Atxn3Q9CVD2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Atxn3Q9CVD2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Atxn3Q9CVD2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
Atxn3Q9CVD2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Atxn3Q9CVD2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atxn3Q9CVD2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Atxn3Q9CVD2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atxn3Q9CVD2 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Atxn3Q9CVD2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atxn3Q9CVD2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atxn3Q9CVD2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Atxn3Q9CVD2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Atxn3Q9CVD2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Atxn3Q9CVD2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms