Protein–RNA interactions for Protein: Q9CT10

Ranbp3, Ran-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ranbp3Q9CT10 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ranbp3Q9CT10 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ranbp3Q9CT10 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ranbp3Q9CT10 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ranbp3Q9CT10 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ranbp3Q9CT10 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ranbp3Q9CT10 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ranbp3Q9CT10 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ranbp3Q9CT10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ranbp3Q9CT10 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ranbp3Q9CT10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ranbp3Q9CT10 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ranbp3Q9CT10 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ranbp3Q9CT10 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ranbp3Q9CT10 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ranbp3Q9CT10 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ranbp3Q9CT10 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ranbp3Q9CT10 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Ranbp3Q9CT10 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ranbp3Q9CT10 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ranbp3Q9CT10 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ranbp3Q9CT10 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms