Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS00

Cactin, Cactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 772 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CactinQ9CS00 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CactinQ9CS00 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CactinQ9CS00 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CactinQ9CS00 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CactinQ9CS00 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CactinQ9CS00 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CactinQ9CS00 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CactinQ9CS00 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CactinQ9CS00 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CactinQ9CS00 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CactinQ9CS00 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CactinQ9CS00 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CactinQ9CS00 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CactinQ9CS00 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CactinQ9CS00 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CactinQ9CS00 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CactinQ9CS00 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CactinQ9CS00 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CactinQ9CS00 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CactinQ9CS00 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CactinQ9CS00 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CactinQ9CS00 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CactinQ9CS00 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CactinQ9CS00 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CactinQ9CS00 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CactinQ9CS00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CactinQ9CS00 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CactinQ9CS00 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CactinQ9CS00 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CactinQ9CS00 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CactinQ9CS00 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CactinQ9CS00 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CactinQ9CS00 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CactinQ9CS00 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CactinQ9CS00 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CactinQ9CS00 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CactinQ9CS00 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CactinQ9CS00 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CactinQ9CS00 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CactinQ9CS00 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CactinQ9CS00 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CactinQ9CS00 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CactinQ9CS00 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CactinQ9CS00 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CactinQ9CS00 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CactinQ9CS00 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CactinQ9CS00 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CactinQ9CS00 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CactinQ9CS00 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CactinQ9CS00 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CactinQ9CS00 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CactinQ9CS00 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CactinQ9CS00 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
CactinQ9CS00 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CactinQ9CS00 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CactinQ9CS00 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CactinQ9CS00 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CactinQ9CS00 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CactinQ9CS00 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CactinQ9CS00 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CactinQ9CS00 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CactinQ9CS00 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CactinQ9CS00 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CactinQ9CS00 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CactinQ9CS00 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CactinQ9CS00 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CactinQ9CS00 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CactinQ9CS00 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CactinQ9CS00 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CactinQ9CS00 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms