Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA7

Atp5s, ATP synthase subunit s, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5sQ9CRA7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Atp5sQ9CRA7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Atp5sQ9CRA7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Atp5sQ9CRA7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Atp5sQ9CRA7 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5sQ9CRA7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Atp5sQ9CRA7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Atp5sQ9CRA7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Atp5sQ9CRA7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Atp5sQ9CRA7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Atp5sQ9CRA7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Atp5sQ9CRA7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atp5sQ9CRA7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atp5sQ9CRA7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Atp5sQ9CRA7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Atp5sQ9CRA7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Atp5sQ9CRA7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Atp5sQ9CRA7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Atp5sQ9CRA7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Atp5sQ9CRA7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Atp5sQ9CRA7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Atp5sQ9CRA7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms