Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI4

Nwc, Uncharacterized protein C11orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NwcQ9CQI4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NwcQ9CQI4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NwcQ9CQI4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NwcQ9CQI4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NwcQ9CQI4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NwcQ9CQI4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NwcQ9CQI4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NwcQ9CQI4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NwcQ9CQI4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NwcQ9CQI4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NwcQ9CQI4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NwcQ9CQI4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NwcQ9CQI4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NwcQ9CQI4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NwcQ9CQI4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NwcQ9CQI4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NwcQ9CQI4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NwcQ9CQI4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NwcQ9CQI4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NwcQ9CQI4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NwcQ9CQI4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NwcQ9CQI4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NwcQ9CQI4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NwcQ9CQI4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NwcQ9CQI4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NwcQ9CQI4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NwcQ9CQI4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NwcQ9CQI4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NwcQ9CQI4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NwcQ9CQI4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NwcQ9CQI4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NwcQ9CQI4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NwcQ9CQI4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NwcQ9CQI4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NwcQ9CQI4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
NwcQ9CQI4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NwcQ9CQI4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms