Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ90

Uncharacterized protein C9orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQ90 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQ90 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQ90 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQ90 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQ90 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQ90 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQ90 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQ90 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQ90 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Q9CQ90 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CQ90 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CQ90 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Q9CQ90 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Q9CQ90 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CQ90 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CQ90 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Q9CQ90 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQ90 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9CQ90 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQ90 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQ90 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9CQ90 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQ90 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9CQ90 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9CQ90 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9CQ90 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9CQ90 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQ90 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQ90 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQ90 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQ90 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q9CQ90 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9CQ90 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q9CQ90 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQ90 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQ90 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q9CQ90 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQ90 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q9CQ90 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Q9CQ90 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQ90 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Q9CQ90 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Q9CQ90 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Q9CQ90 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQ90 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQ90 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Q9CQ90 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Q9CQ90 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Q9CQ90 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQ90 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9CQ90 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q9CQ90 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQ90 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Q9CQ90 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Q9CQ90 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQ90 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Q9CQ90 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms