Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lrrc18Q9CQ07 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc18Q9CQ07 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc18Q9CQ07 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc18Q9CQ07 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc18Q9CQ07 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lrrc18Q9CQ07 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc18Q9CQ07 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc18Q9CQ07 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc18Q9CQ07 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lrrc18Q9CQ07 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc18Q9CQ07 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc18Q9CQ07 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc18Q9CQ07 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc18Q9CQ07 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lrrc18Q9CQ07 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Lrrc18Q9CQ07 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lrrc18Q9CQ07 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Lrrc18Q9CQ07 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Lrrc18Q9CQ07 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrrc18Q9CQ07 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrrc18Q9CQ07 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc18Q9CQ07 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrrc18Q9CQ07 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc18Q9CQ07 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrrc18Q9CQ07 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Lrrc18Q9CQ07 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms