Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPT7

4930519G04Rik, RIKEN cDNA 4930519G04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519G04RikQ9CPT7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
4930519G04RikQ9CPT7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
4930519G04RikQ9CPT7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
4930519G04RikQ9CPT7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
4930519G04RikQ9CPT7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930519G04RikQ9CPT7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
4930519G04RikQ9CPT7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
4930519G04RikQ9CPT7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930519G04RikQ9CPT7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
4930519G04RikQ9CPT7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25■■□□□ 1.59
4930519G04RikQ9CPT7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
4930519G04RikQ9CPT7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
4930519G04RikQ9CPT7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
4930519G04RikQ9CPT7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
4930519G04RikQ9CPT7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
4930519G04RikQ9CPT7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
4930519G04RikQ9CPT7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
4930519G04RikQ9CPT7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930519G04RikQ9CPT7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
4930519G04RikQ9CPT7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
4930519G04RikQ9CPT7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
4930519G04RikQ9CPT7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
4930519G04RikQ9CPT7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930519G04RikQ9CPT7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
4930519G04RikQ9CPT7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930519G04RikQ9CPT7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930519G04RikQ9CPT7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
4930519G04RikQ9CPT7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
4930519G04RikQ9CPT7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
4930519G04RikQ9CPT7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
4930519G04RikQ9CPT7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930519G04RikQ9CPT7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4930519G04RikQ9CPT7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4930519G04RikQ9CPT7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4930519G04RikQ9CPT7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
4930519G04RikQ9CPT7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930519G04RikQ9CPT7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4930519G04RikQ9CPT7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
4930519G04RikQ9CPT7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4930519G04RikQ9CPT7 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
4930519G04RikQ9CPT7 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
4930519G04RikQ9CPT7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
4930519G04RikQ9CPT7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
4930519G04RikQ9CPT7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
4930519G04RikQ9CPT7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms