Protein–RNA interactions for Protein: Q99PF4

Cdh23, Cadherin-23, mousemouse

Predictions only

Length 3,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh23Q99PF4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Cdh23Q99PF4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdh23Q99PF4 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdh23Q99PF4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cdh23Q99PF4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cdh23Q99PF4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cdh23Q99PF4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cdh23Q99PF4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdh23Q99PF4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cdh23Q99PF4 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Cdh23Q99PF4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cdh23Q99PF4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdh23Q99PF4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdh23Q99PF4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cdh23Q99PF4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cdh23Q99PF4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdh23Q99PF4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cdh23Q99PF4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cdh23Q99PF4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cdh23Q99PF4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cdh23Q99PF4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cdh23Q99PF4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cdh23Q99PF4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cdh23Q99PF4 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cdh23Q99PF4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cdh23Q99PF4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Cdh23Q99PF4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh23Q99PF4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cdh23Q99PF4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cdh23Q99PF4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cdh23Q99PF4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cdh23Q99PF4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cdh23Q99PF4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cdh23Q99PF4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdh23Q99PF4 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Cdh23Q99PF4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh23Q99PF4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cdh23Q99PF4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh23Q99PF4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cdh23Q99PF4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cdh23Q99PF4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cdh23Q99PF4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdh23Q99PF4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cdh23Q99PF4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cdh23Q99PF4 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdh23Q99PF4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cdh23Q99PF4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Cdh23Q99PF4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdh23Q99PF4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cdh23Q99PF4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh23Q99PF4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Cdh23Q99PF4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdh23Q99PF4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cdh23Q99PF4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cdh23Q99PF4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Cdh23Q99PF4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cdh23Q99PF4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cdh23Q99PF4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Cdh23Q99PF4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cdh23Q99PF4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cdh23Q99PF4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cdh23Q99PF4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cdh23Q99PF4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Cdh23Q99PF4 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cdh23Q99PF4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cdh23Q99PF4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Cdh23Q99PF4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdh23Q99PF4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cdh23Q99PF4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cdh23Q99PF4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cdh23Q99PF4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cdh23Q99PF4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cdh23Q99PF4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdh23Q99PF4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdh23Q99PF4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cdh23Q99PF4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cdh23Q99PF4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh23Q99PF4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cdh23Q99PF4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cdh23Q99PF4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cdh23Q99PF4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cdh23Q99PF4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Cdh23Q99PF4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh23Q99PF4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cdh23Q99PF4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh23Q99PF4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Cdh23Q99PF4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdh23Q99PF4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdh23Q99PF4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cdh23Q99PF4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms