Protein–RNA interactions for Protein: Q99PD7

Slc24a3, Sodium/potassium/calcium exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 645 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc24a3Q99PD7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc24a3Q99PD7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc24a3Q99PD7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc24a3Q99PD7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc24a3Q99PD7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc24a3Q99PD7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc24a3Q99PD7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc24a3Q99PD7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc24a3Q99PD7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc24a3Q99PD7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc24a3Q99PD7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc24a3Q99PD7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc24a3Q99PD7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc24a3Q99PD7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc24a3Q99PD7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc24a3Q99PD7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc24a3Q99PD7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc24a3Q99PD7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc24a3Q99PD7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc24a3Q99PD7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc24a3Q99PD7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc24a3Q99PD7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc24a3Q99PD7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc24a3Q99PD7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc24a3Q99PD7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc24a3Q99PD7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc24a3Q99PD7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc24a3Q99PD7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc24a3Q99PD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc24a3Q99PD7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc24a3Q99PD7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc24a3Q99PD7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms