Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
4930550L24RikQ99PA7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
4930550L24RikQ99PA7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
4930550L24RikQ99PA7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
4930550L24RikQ99PA7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
4930550L24RikQ99PA7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
4930550L24RikQ99PA7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
4930550L24RikQ99PA7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
4930550L24RikQ99PA7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
4930550L24RikQ99PA7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930550L24RikQ99PA7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
4930550L24RikQ99PA7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
4930550L24RikQ99PA7 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
4930550L24RikQ99PA7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
4930550L24RikQ99PA7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
4930550L24RikQ99PA7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
4930550L24RikQ99PA7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930550L24RikQ99PA7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
4930550L24RikQ99PA7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
4930550L24RikQ99PA7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms