Protein–RNA interactions for Protein: Q99P47

Cntnap4, Contactin-associated protein-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap4Q99P47 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Cntnap4Q99P47 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cntnap4Q99P47 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Cntnap4Q99P47 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cntnap4Q99P47 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cntnap4Q99P47 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Cntnap4Q99P47 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Cntnap4Q99P47 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Cntnap4Q99P47 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cntnap4Q99P47 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cntnap4Q99P47 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Cntnap4Q99P47 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cntnap4Q99P47 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Cntnap4Q99P47 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cntnap4Q99P47 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cntnap4Q99P47 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cntnap4Q99P47 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cntnap4Q99P47 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Cntnap4Q99P47 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cntnap4Q99P47 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Cntnap4Q99P47 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cntnap4Q99P47 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cntnap4Q99P47 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cntnap4Q99P47 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Cntnap4Q99P47 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cntnap4Q99P47 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cntnap4Q99P47 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Cntnap4Q99P47 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cntnap4Q99P47 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cntnap4Q99P47 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Cntnap4Q99P47 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cntnap4Q99P47 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cntnap4Q99P47 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Cntnap4Q99P47 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cntnap4Q99P47 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Cntnap4Q99P47 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Cntnap4Q99P47 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Cntnap4Q99P47 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Cntnap4Q99P47 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Cntnap4Q99P47 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cntnap4Q99P47 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Cntnap4Q99P47 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cntnap4Q99P47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cntnap4Q99P47 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cntnap4Q99P47 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cntnap4Q99P47 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Cntnap4Q99P47 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cntnap4Q99P47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Cntnap4Q99P47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Cntnap4Q99P47 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cntnap4Q99P47 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Cntnap4Q99P47 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntnap4Q99P47 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntnap4Q99P47 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntnap4Q99P47 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cntnap4Q99P47 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cntnap4Q99P47 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cntnap4Q99P47 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cntnap4Q99P47 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cntnap4Q99P47 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cntnap4Q99P47 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cntnap4Q99P47 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cntnap4Q99P47 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Cntnap4Q99P47 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.9 ms