Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep41Q99NF3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep41Q99NF3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cep41Q99NF3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cep41Q99NF3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cep41Q99NF3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cep41Q99NF3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cep41Q99NF3 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cep41Q99NF3 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cep41Q99NF3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cep41Q99NF3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep41Q99NF3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cep41Q99NF3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cep41Q99NF3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cep41Q99NF3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep41Q99NF3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cep41Q99NF3 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cep41Q99NF3 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep41Q99NF3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep41Q99NF3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cep41Q99NF3 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cep41Q99NF3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cep41Q99NF3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cep41Q99NF3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep41Q99NF3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cep41Q99NF3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cep41Q99NF3 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep41Q99NF3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep41Q99NF3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cep41Q99NF3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep41Q99NF3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep41Q99NF3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep41Q99NF3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep41Q99NF3 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep41Q99NF3 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep41Q99NF3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cep41Q99NF3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep41Q99NF3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep41Q99NF3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep41Q99NF3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep41Q99NF3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cep41Q99NF3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep41Q99NF3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep41Q99NF3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep41Q99NF3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms