Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ5

Cmtm3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm3Q99LJ5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmtm3Q99LJ5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm3Q99LJ5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm3Q99LJ5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmtm3Q99LJ5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmtm3Q99LJ5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cmtm3Q99LJ5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm3Q99LJ5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cmtm3Q99LJ5 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm3Q99LJ5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cmtm3Q99LJ5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cmtm3Q99LJ5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cmtm3Q99LJ5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cmtm3Q99LJ5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtm3Q99LJ5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtm3Q99LJ5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cmtm3Q99LJ5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm3Q99LJ5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm3Q99LJ5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cmtm3Q99LJ5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cmtm3Q99LJ5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm3Q99LJ5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm3Q99LJ5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cmtm3Q99LJ5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cmtm3Q99LJ5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm3Q99LJ5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Cmtm3Q99LJ5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cmtm3Q99LJ5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cmtm3Q99LJ5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm3Q99LJ5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm3Q99LJ5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cmtm3Q99LJ5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cmtm3Q99LJ5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm3Q99LJ5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cmtm3Q99LJ5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cmtm3Q99LJ5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cmtm3Q99LJ5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cmtm3Q99LJ5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cmtm3Q99LJ5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cmtm3Q99LJ5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm3Q99LJ5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cmtm3Q99LJ5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cmtm3Q99LJ5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cmtm3Q99LJ5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Cmtm3Q99LJ5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cmtm3Q99LJ5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms