Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE1

Rilpl2, RILP-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rilpl2Q99LE1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Rilpl2Q99LE1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rilpl2Q99LE1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rilpl2Q99LE1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rilpl2Q99LE1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rilpl2Q99LE1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rilpl2Q99LE1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rilpl2Q99LE1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rilpl2Q99LE1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rilpl2Q99LE1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rilpl2Q99LE1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rilpl2Q99LE1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rilpl2Q99LE1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rilpl2Q99LE1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rilpl2Q99LE1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rilpl2Q99LE1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Rilpl2Q99LE1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Rilpl2Q99LE1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rilpl2Q99LE1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rilpl2Q99LE1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rilpl2Q99LE1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rilpl2Q99LE1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rilpl2Q99LE1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rilpl2Q99LE1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rilpl2Q99LE1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rilpl2Q99LE1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Rilpl2Q99LE1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rilpl2Q99LE1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Rilpl2Q99LE1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Rilpl2Q99LE1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Rilpl2Q99LE1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rilpl2Q99LE1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rilpl2Q99LE1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Rilpl2Q99LE1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rilpl2Q99LE1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Rilpl2Q99LE1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rilpl2Q99LE1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rilpl2Q99LE1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rilpl2Q99LE1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rilpl2Q99LE1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Rilpl2Q99LE1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rilpl2Q99LE1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rilpl2Q99LE1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Rilpl2Q99LE1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rilpl2Q99LE1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rilpl2Q99LE1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rilpl2Q99LE1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rilpl2Q99LE1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rilpl2Q99LE1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rilpl2Q99LE1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rilpl2Q99LE1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Rilpl2Q99LE1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rilpl2Q99LE1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Rilpl2Q99LE1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rilpl2Q99LE1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Rilpl2Q99LE1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rilpl2Q99LE1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rilpl2Q99LE1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rilpl2Q99LE1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rilpl2Q99LE1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rilpl2Q99LE1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rilpl2Q99LE1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Rilpl2Q99LE1 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rilpl2Q99LE1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Rilpl2Q99LE1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Rilpl2Q99LE1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Rilpl2Q99LE1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rilpl2Q99LE1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rilpl2Q99LE1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Rilpl2Q99LE1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rilpl2Q99LE1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rilpl2Q99LE1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms